Требуется если сайт заливается на хостинг через аккаунт root.
root@job:/директория размещения сайтов до site-folder/ # chown -R user:user site-folder/
root@job:/директория размещения сайтов до site-folder/# chmod -R 644 site-folder/
root@job:директория размещения сайтов до site-folder/# find site-folder/ -type d -print0 | xargs -0 chmod 755
Обязательно к выполнению, иначе пользовательская учетная запись не сможет работать с файлами.
Так же возможны ошибки в работе .php